Siglo II a.C.. Las tribus indígenas celtíberas se asentaron en el Cerro el Risco. Se han encontrado huellas arqueológicas de cerámica, Molinos de mano y rotación. (Ahora depositados en el museo najerillense).
Época romana. Probablemente la mansión Atiliana, del Itinerario de Antonio, se encuentra en la localidad, cercana a las ruinas de San Pedro de Ruego. Por aquí pasa la calzada romana que de Tricio se dirigía a la desembocadura del Tuerto, para continuar hacia Hormilla por el camino hoy conocido de la Media Legua.
Siglos VII y VIII. Los pobladores de “Formelleia” se desplazaron a la zona de la redonda donde existe una necrópolis medieval y se han encontrado estelas indígenas como La Amazona de Hormilleja.
Edad Media. Fue señoría de las Monjas Bernardas del Monasterio Cañas, que ponian su alcalde ordinario.
Siglo XII. “Ormillexa” se desplaza hasta su situación actual a orillas del río Tuerto.
Siglos XIV y XVII. Perteneció a la junta de Valpierre.
Siglos XVI. En el censo de población de castilla, aparece con 75 Almas.
1833. Hasta la creación de la provincia de Logroño, Hormilleja perteneció a la de Burgos.
1840. En el censo de creación de la provincia de Logroño aparece Hormilleja con 174 almas.
1960. Hasta esta fecha, en el término El Soto, existían las ruinas de la ermita de San Pedro de Ruego.